内科学系前身为内科学教研室，创建于1936年。2003年11月正式下文成立内科学系，下设内科学和诊断学2个2级教研宝，涵盖心血管病学、呼吸系病学、消化系病学、内分泌与代谢病学、肾病学、风湿病学、血液病学和传染病学8个3级教研宝。现为国家重点学科培育点、省级优秀课程群单位、省精品课程单位。内科学系以临床医学五年制教育为基础，研究生教育为重点，为我国临床医学事业培养了众多医学专业人才，在国内医学教育界具有较高声誉。

学系现有教师390余名，教授56人，副教授102人，博士生导师51人、硕士生导师100人，其中具有十个月以上海外研修经历的66人，具有博士学位计175人。平均完成南京医科大学内科学和诊断学理论课 4743学时/年，实习/见习课1954学时/年，组织各级各类学生技能培训近百次，每年培养研究生授予学位者博士一百多人，硕士四百多人。新获国家级、省级人才多项项目。在多年的教学实践中不断完善理论和实际技能教学，已为我国临床医学事业培养了众多医学专业人才，在国内医学教育界具有较高声誉。目前，本学科发展协调均衡，整体科研、医疗和教学水平居国内先进水平。

系主任：  陈明龙(教授主任医师博士生导师)

系副主任： 孙敏(教授主任医师博士生导师)

       欧阳春(副教授主任医师硕士生导师)